Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms