Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ITGB4P16144 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGB4P16144 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms