Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA1P15976 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA1P15976 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA1P15976 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATA1P15976 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GATA1P15976 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATA1P15976 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATA1P15976 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATA1P15976 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GATA1P15976 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATA1P15976 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATA1P15976 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATA1P15976 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATA1P15976 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATA1P15976 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATA1P15976 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATA1P15976 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATA1P15976 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATA1P15976 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GATA1P15976 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GATA1P15976 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GATA1P15976 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GATA1P15976 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GATA1P15976 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GATA1P15976 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GATA1P15976 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GATA1P15976 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GATA1P15976 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GATA1P15976 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GATA1P15976 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA1P15976 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA1P15976 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA1P15976 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA1P15976 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA1P15976 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA1P15976 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA1P15976 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA1P15976 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA1P15976 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA1P15976 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA1P15976 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA1P15976 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA1P15976 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA1P15976 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA1P15976 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA1P15976 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA1P15976 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA1P15976 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA1P15976 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA1P15976 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA1P15976 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA1P15976 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA1P15976 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA1P15976 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA1P15976 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA1P15976 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA1P15976 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA1P15976 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA1P15976 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA1P15976 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA1P15976 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA1P15976 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA1P15976 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA1P15976 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA1P15976 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA1P15976 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA1P15976 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA1P15976 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA1P15976 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA1P15976 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA1P15976 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA1P15976 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA1P15976 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA1P15976 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA1P15976 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA1P15976 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA1P15976 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA1P15976 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA1P15976 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA1P15976 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA1P15976 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA1P15976 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA1P15976 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA1P15976 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA1P15976 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA1P15976 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA1P15976 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA1P15976 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA1P15976 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA1P15976 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA1P15976 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA1P15976 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA1P15976 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA1P15976 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA1P15976 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA1P15976 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA1P15976 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA1P15976 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA1P15976 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA1P15976 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms