Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME1P15531 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME1P15531 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME1P15531 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME1P15531 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NME1P15531 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME1P15531 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME1P15531 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME1P15531 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME1P15531 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME1P15531 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME1P15531 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NME1P15531 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NME1P15531 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME1P15531 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME1P15531 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME1P15531 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME1P15531 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME1P15531 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME1P15531 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME1P15531 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME1P15531 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME1P15531 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME1P15531 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME1P15531 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME1P15531 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME1P15531 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME1P15531 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME1P15531 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME1P15531 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME1P15531 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME1P15531 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME1P15531 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME1P15531 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NME1P15531 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME1P15531 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME1P15531 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME1P15531 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME1P15531 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME1P15531 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME1P15531 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME1P15531 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME1P15531 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME1P15531 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME1P15531 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME1P15531 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME1P15531 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME1P15531 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME1P15531 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME1P15531 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME1P15531 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NME1P15531 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME1P15531 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME1P15531 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME1P15531 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME1P15531 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME1P15531 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NME1P15531 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NME1P15531 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NME1P15531 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NME1P15531 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NME1P15531 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NME1P15531 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NME1P15531 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NME1P15531 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NME1P15531 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NME1P15531 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NME1P15531 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NME1P15531 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NME1P15531 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NME1P15531 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME1P15531 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME1P15531 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME1P15531 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME1P15531 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME1P15531 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME1P15531 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME1P15531 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME1P15531 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME1P15531 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME1P15531 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME1P15531 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME1P15531 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME1P15531 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME1P15531 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME1P15531 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME1P15531 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME1P15531 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME1P15531 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME1P15531 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME1P15531 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME1P15531 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME1P15531 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME1P15531 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME1P15531 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME1P15531 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME1P15531 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME1P15531 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME1P15531 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NME1P15531 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms