Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRAFP15056 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BRAFP15056 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRAFP15056 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRAFP15056 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BRAFP15056 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRAFP15056 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRAFP15056 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRAFP15056 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRAFP15056 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRAFP15056 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRAFP15056 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRAFP15056 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRAFP15056 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRAFP15056 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRAFP15056 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRAFP15056 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRAFP15056 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRAFP15056 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRAFP15056 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRAFP15056 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRAFP15056 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRAFP15056 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRAFP15056 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BRAFP15056 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRAFP15056 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRAFP15056 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRAFP15056 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BRAFP15056 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BRAFP15056 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRAFP15056 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRAFP15056 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRAFP15056 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRAFP15056 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRAFP15056 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRAFP15056 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRAFP15056 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRAFP15056 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRAFP15056 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRAFP15056 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRAFP15056 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRAFP15056 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRAFP15056 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRAFP15056 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRAFP15056 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRAFP15056 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRAFP15056 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BRAFP15056 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BRAFP15056 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BRAFP15056 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
BRAFP15056 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
BRAFP15056 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRAFP15056 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRAFP15056 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BRAFP15056 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BRAFP15056 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRAFP15056 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
BRAFP15056 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BRAFP15056 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRAFP15056 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
BRAFP15056 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
BRAFP15056 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BRAFP15056 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BRAFP15056 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRAFP15056 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRAFP15056 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BRAFP15056 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRAFP15056 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRAFP15056 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BRAFP15056 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BRAFP15056 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRAFP15056 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRAFP15056 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRAFP15056 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRAFP15056 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BRAFP15056 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRAFP15056 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BRAFP15056 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BRAFP15056 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRAFP15056 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
BRAFP15056 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRAFP15056 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BRAFP15056 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BRAFP15056 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRAFP15056 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRAFP15056 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRAFP15056 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRAFP15056 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BRAFP15056 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRAFP15056 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRAFP15056 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRAFP15056 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BRAFP15056 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRAFP15056 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BRAFP15056 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BRAFP15056 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BRAFP15056 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BRAFP15056 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BRAFP15056 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BRAFP15056 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms