Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNRPBP14678 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms