Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms