Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HLA-EP13747 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HLA-EP13747 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HLA-EP13747 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HLA-EP13747 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLA-EP13747 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms