Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRFP10586 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms