Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
GLI4P10075 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
GLI4P10075 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GLI4P10075 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GLI4P10075 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GLI4P10075 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GLI4P10075 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GLI4P10075 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GLI4P10075 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GLI4P10075 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GLI4P10075 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GLI4P10075 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GLI4P10075 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GLI4P10075 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GLI4P10075 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GLI4P10075 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GLI4P10075 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GLI4P10075 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GLI4P10075 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GLI4P10075 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GLI4P10075 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GLI4P10075 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GLI4P10075 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GLI4P10075 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GLI4P10075 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GLI4P10075 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GLI4P10075 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GLI4P10075 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GLI4P10075 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GLI4P10075 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GLI4P10075 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GLI4P10075 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GLI4P10075 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GLI4P10075 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GLI4P10075 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GLI4P10075 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GLI4P10075 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GLI4P10075 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GLI4P10075 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GLI4P10075 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GLI4P10075 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GLI4P10075 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GLI4P10075 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GLI4P10075 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI4P10075 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI4P10075 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI4P10075 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI4P10075 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI4P10075 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI4P10075 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI4P10075 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI4P10075 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI4P10075 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI4P10075 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI4P10075 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI4P10075 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI4P10075 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI4P10075 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI4P10075 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI4P10075 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI4P10075 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI4P10075 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI4P10075 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI4P10075 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI4P10075 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI4P10075 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI4P10075 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI4P10075 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI4P10075 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI4P10075 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI4P10075 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI4P10075 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI4P10075 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI4P10075 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI4P10075 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI4P10075 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI4P10075 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI4P10075 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI4P10075 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GLI4P10075 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GLI4P10075 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GLI4P10075 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GLI4P10075 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GLI4P10075 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GLI4P10075 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GLI4P10075 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GLI4P10075 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GLI4P10075 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GLI4P10075 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GLI4P10075 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GLI4P10075 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GLI4P10075 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GLI4P10075 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GLI4P10075 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GLI4P10075 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GLI4P10075 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GLI4P10075 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GLI4P10075 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GLI4P10075 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GLI4P10075 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms