Protein–RNA interactions for Protein: P0DP09

IGKV1-13, Immunoglobulin kappa variable 1-13, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-13P0DP09 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGKV1-13P0DP09 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms