Protein–RNA interactions for Protein: P0DJJ0

SRGAP2C, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2CP0DJJ0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRGAP2CP0DJJ0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRGAP2CP0DJJ0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRGAP2CP0DJJ0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRGAP2CP0DJJ0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRGAP2CP0DJJ0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRGAP2CP0DJJ0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRGAP2CP0DJJ0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRGAP2CP0DJJ0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRGAP2CP0DJJ0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRGAP2CP0DJJ0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRGAP2CP0DJJ0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRGAP2CP0DJJ0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRGAP2CP0DJJ0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRGAP2CP0DJJ0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRGAP2CP0DJJ0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRGAP2CP0DJJ0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRGAP2CP0DJJ0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRGAP2CP0DJJ0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRGAP2CP0DJJ0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRGAP2CP0DJJ0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRGAP2CP0DJJ0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SRGAP2CP0DJJ0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRGAP2CP0DJJ0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRGAP2CP0DJJ0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRGAP2CP0DJJ0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRGAP2CP0DJJ0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRGAP2CP0DJJ0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRGAP2CP0DJJ0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRGAP2CP0DJJ0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRGAP2CP0DJJ0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SRGAP2CP0DJJ0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SRGAP2CP0DJJ0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SRGAP2CP0DJJ0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SRGAP2CP0DJJ0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRGAP2CP0DJJ0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms