Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI8

SAA1, Serum amyloid A-1 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA1P0DJI8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAA1P0DJI8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAA1P0DJI8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAA1P0DJI8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAA1P0DJI8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAA1P0DJI8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAA1P0DJI8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAA1P0DJI8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAA1P0DJI8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAA1P0DJI8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAA1P0DJI8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAA1P0DJI8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAA1P0DJI8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAA1P0DJI8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAA1P0DJI8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAA1P0DJI8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SAA1P0DJI8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAA1P0DJI8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAA1P0DJI8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms