Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms