Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PNMA6AP0CW24 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA6AP0CW24 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA6AP0CW24 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA6AP0CW24 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA6AP0CW24 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA6AP0CW24 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA6AP0CW24 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA6AP0CW24 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA6AP0CW24 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA6AP0CW24 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA6AP0CW24 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA6AP0CW24 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA6AP0CW24 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA6AP0CW24 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA6AP0CW24 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA6AP0CW24 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA6AP0CW24 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA6AP0CW24 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA6AP0CW24 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA6AP0CW24 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA6AP0CW24 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA6AP0CW24 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA6AP0CW24 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA6AP0CW24 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA6AP0CW24 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA6AP0CW24 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA6AP0CW24 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA6AP0CW24 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA6AP0CW24 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA6AP0CW24 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA6AP0CW24 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA6AP0CW24 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA6AP0CW24 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA6AP0CW24 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA6AP0CW24 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA6AP0CW24 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA6AP0CW24 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA6AP0CW24 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA6AP0CW24 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA6AP0CW24 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA6AP0CW24 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA6AP0CW24 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms