Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARP1P09874 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARP1P09874 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARP1P09874 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARP1P09874 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARP1P09874 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARP1P09874 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARP1P09874 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARP1P09874 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARP1P09874 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PARP1P09874 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARP1P09874 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARP1P09874 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARP1P09874 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARP1P09874 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARP1P09874 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARP1P09874 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARP1P09874 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARP1P09874 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARP1P09874 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARP1P09874 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARP1P09874 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARP1P09874 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARP1P09874 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARP1P09874 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARP1P09874 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PARP1P09874 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARP1P09874 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARP1P09874 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PARP1P09874 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PARP1P09874 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PARP1P09874 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PARP1P09874 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PARP1P09874 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PARP1P09874 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PARP1P09874 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PARP1P09874 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PARP1P09874 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PARP1P09874 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PARP1P09874 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PARP1P09874 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PARP1P09874 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PARP1P09874 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PARP1P09874 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PARP1P09874 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PARP1P09874 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PARP1P09874 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PARP1P09874 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PARP1P09874 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PARP1P09874 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PARP1P09874 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PARP1P09874 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARP1P09874 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PARP1P09874 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARP1P09874 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARP1P09874 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARP1P09874 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARP1P09874 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PARP1P09874 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARP1P09874 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARP1P09874 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARP1P09874 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARP1P09874 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARP1P09874 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARP1P09874 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARP1P09874 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARP1P09874 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARP1P09874 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARP1P09874 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARP1P09874 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARP1P09874 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARP1P09874 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARP1P09874 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PARP1P09874 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARP1P09874 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PARP1P09874 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARP1P09874 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARP1P09874 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARP1P09874 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARP1P09874 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARP1P09874 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PARP1P09874 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PARP1P09874 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PARP1P09874 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PARP1P09874 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PARP1P09874 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PARP1P09874 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PARP1P09874 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PARP1P09874 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PARP1P09874 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PARP1P09874 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PARP1P09874 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PARP1P09874 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PARP1P09874 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PARP1P09874 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PARP1P09874 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PARP1P09874 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PARP1P09874 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PARP1P09874 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PARP1P09874 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms