Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms