Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJB1P08034 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJB1P08034 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GJB1P08034 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJB1P08034 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJB1P08034 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GJB1P08034 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJB1P08034 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GJB1P08034 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GJB1P08034 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJB1P08034 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJB1P08034 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJB1P08034 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJB1P08034 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJB1P08034 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJB1P08034 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJB1P08034 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJB1P08034 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJB1P08034 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJB1P08034 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJB1P08034 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GJB1P08034 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJB1P08034 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJB1P08034 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJB1P08034 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJB1P08034 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB1P08034 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB1P08034 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB1P08034 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB1P08034 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB1P08034 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB1P08034 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB1P08034 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB1P08034 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB1P08034 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB1P08034 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB1P08034 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB1P08034 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB1P08034 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB1P08034 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB1P08034 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB1P08034 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB1P08034 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB1P08034 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB1P08034 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB1P08034 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB1P08034 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB1P08034 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB1P08034 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB1P08034 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB1P08034 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB1P08034 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB1P08034 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB1P08034 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB1P08034 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB1P08034 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB1P08034 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB1P08034 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB1P08034 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB1P08034 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB1P08034 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB1P08034 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB1P08034 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB1P08034 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB1P08034 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB1P08034 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB1P08034 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB1P08034 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB1P08034 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB1P08034 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB1P08034 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB1P08034 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB1P08034 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB1P08034 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB1P08034 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB1P08034 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB1P08034 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB1P08034 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB1P08034 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB1P08034 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB1P08034 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB1P08034 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB1P08034 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB1P08034 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB1P08034 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB1P08034 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB1P08034 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB1P08034 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB1P08034 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB1P08034 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB1P08034 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB1P08034 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB1P08034 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB1P08034 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB1P08034 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB1P08034 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB1P08034 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB1P08034 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB1P08034 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB1P08034 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms