Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CENPBP07199 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CENPBP07199 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CENPBP07199 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CENPBP07199 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CENPBP07199 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CENPBP07199 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CENPBP07199 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CENPBP07199 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CENPBP07199 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CENPBP07199 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CENPBP07199 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CENPBP07199 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CENPBP07199 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CENPBP07199 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CENPBP07199 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CENPBP07199 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CENPBP07199 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CENPBP07199 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CENPBP07199 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CENPBP07199 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CENPBP07199 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CENPBP07199 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CENPBP07199 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CENPBP07199 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CENPBP07199 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CENPBP07199 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CENPBP07199 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CENPBP07199 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CENPBP07199 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CENPBP07199 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CENPBP07199 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CENPBP07199 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CENPBP07199 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CENPBP07199 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CENPBP07199 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CENPBP07199 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CENPBP07199 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CENPBP07199 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CENPBP07199 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CENPBP07199 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CENPBP07199 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CENPBP07199 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CENPBP07199 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CENPBP07199 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CENPBP07199 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CENPBP07199 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CENPBP07199 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CENPBP07199 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CENPBP07199 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CENPBP07199 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CENPBP07199 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CENPBP07199 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CENPBP07199 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CENPBP07199 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CENPBP07199 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CENPBP07199 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CENPBP07199 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CENPBP07199 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CENPBP07199 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CENPBP07199 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CENPBP07199 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CENPBP07199 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CENPBP07199 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CENPBP07199 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CENPBP07199 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CENPBP07199 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CENPBP07199 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CENPBP07199 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CENPBP07199 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CENPBP07199 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CENPBP07199 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CENPBP07199 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CENPBP07199 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CENPBP07199 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CENPBP07199 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CENPBP07199 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CENPBP07199 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CENPBP07199 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CENPBP07199 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CENPBP07199 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CENPBP07199 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CENPBP07199 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CENPBP07199 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CENPBP07199 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CENPBP07199 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CENPBP07199 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CENPBP07199 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CENPBP07199 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CENPBP07199 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CENPBP07199 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CENPBP07199 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CENPBP07199 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CENPBP07199 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CENPBP07199 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CENPBP07199 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CENPBP07199 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CENPBP07199 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CENPBP07199 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CENPBP07199 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms