Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYBBP04839 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYBBP04839 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CYBBP04839 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYBBP04839 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYBBP04839 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYBBP04839 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYBBP04839 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYBBP04839 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYBBP04839 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYBBP04839 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYBBP04839 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYBBP04839 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CYBBP04839 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYBBP04839 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYBBP04839 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYBBP04839 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYBBP04839 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYBBP04839 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYBBP04839 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYBBP04839 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYBBP04839 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYBBP04839 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYBBP04839 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYBBP04839 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYBBP04839 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYBBP04839 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYBBP04839 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYBBP04839 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
CYBBP04839 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CYBBP04839 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYBBP04839 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYBBP04839 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CYBBP04839 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYBBP04839 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYBBP04839 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYBBP04839 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CYBBP04839 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYBBP04839 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYBBP04839 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYBBP04839 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYBBP04839 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYBBP04839 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYBBP04839 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYBBP04839 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYBBP04839 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYBBP04839 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYBBP04839 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYBBP04839 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYBBP04839 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYBBP04839 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYBBP04839 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYBBP04839 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYBBP04839 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYBBP04839 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYBBP04839 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYBBP04839 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CYBBP04839 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYBBP04839 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYBBP04839 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYBBP04839 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYBBP04839 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYBBP04839 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYBBP04839 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYBBP04839 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CYBBP04839 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYBBP04839 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYBBP04839 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYBBP04839 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYBBP04839 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYBBP04839 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYBBP04839 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYBBP04839 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYBBP04839 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYBBP04839 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYBBP04839 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYBBP04839 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYBBP04839 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYBBP04839 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYBBP04839 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYBBP04839 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYBBP04839 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CYBBP04839 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYBBP04839 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYBBP04839 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYBBP04839 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYBBP04839 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYBBP04839 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYBBP04839 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYBBP04839 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYBBP04839 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYBBP04839 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYBBP04839 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CYBBP04839 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYBBP04839 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYBBP04839 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYBBP04839 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYBBP04839 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYBBP04839 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYBBP04839 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms