Protein–RNA interactions for Protein: P01599

IGKV1-17, Immunoglobulin kappa variable 1-17, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-17P01599 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms