Protein–RNA interactions for Protein: P00966

ASS1, Argininosuccinate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASS1P00966 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASS1P00966 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASS1P00966 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASS1P00966 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASS1P00966 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASS1P00966 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASS1P00966 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASS1P00966 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASS1P00966 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASS1P00966 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASS1P00966 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ASS1P00966 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASS1P00966 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASS1P00966 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASS1P00966 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASS1P00966 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASS1P00966 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASS1P00966 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASS1P00966 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASS1P00966 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASS1P00966 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASS1P00966 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASS1P00966 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASS1P00966 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASS1P00966 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASS1P00966 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASS1P00966 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASS1P00966 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ASS1P00966 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASS1P00966 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASS1P00966 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASS1P00966 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASS1P00966 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASS1P00966 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASS1P00966 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASS1P00966 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASS1P00966 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ASS1P00966 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASS1P00966 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASS1P00966 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASS1P00966 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASS1P00966 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASS1P00966 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASS1P00966 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASS1P00966 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASS1P00966 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASS1P00966 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASS1P00966 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASS1P00966 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ASS1P00966 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASS1P00966 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASS1P00966 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASS1P00966 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASS1P00966 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASS1P00966 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASS1P00966 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASS1P00966 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASS1P00966 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASS1P00966 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASS1P00966 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASS1P00966 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASS1P00966 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASS1P00966 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASS1P00966 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASS1P00966 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ASS1P00966 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASS1P00966 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ASS1P00966 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASS1P00966 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASS1P00966 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ASS1P00966 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ASS1P00966 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ASS1P00966 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ASS1P00966 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ASS1P00966 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ASS1P00966 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ASS1P00966 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
ASS1P00966 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ASS1P00966 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASS1P00966 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASS1P00966 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASS1P00966 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASS1P00966 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ASS1P00966 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASS1P00966 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASS1P00966 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASS1P00966 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASS1P00966 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASS1P00966 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASS1P00966 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASS1P00966 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASS1P00966 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASS1P00966 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASS1P00966 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASS1P00966 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASS1P00966 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASS1P00966 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASS1P00966 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASS1P00966 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASS1P00966 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms