Protein–RNA interactions for Protein: P00488

F13A1, Coagulation factor XIII A chain, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13A1P00488 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
F13A1P00488 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
F13A1P00488 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
F13A1P00488 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
F13A1P00488 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
F13A1P00488 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
F13A1P00488 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
F13A1P00488 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
F13A1P00488 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
F13A1P00488 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
F13A1P00488 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
F13A1P00488 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
F13A1P00488 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
F13A1P00488 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
F13A1P00488 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
F13A1P00488 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
F13A1P00488 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
F13A1P00488 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
F13A1P00488 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
F13A1P00488 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
F13A1P00488 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
F13A1P00488 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
F13A1P00488 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
F13A1P00488 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
F13A1P00488 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
F13A1P00488 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
F13A1P00488 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
F13A1P00488 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
F13A1P00488 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
F13A1P00488 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
F13A1P00488 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
F13A1P00488 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
F13A1P00488 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
F13A1P00488 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
F13A1P00488 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
F13A1P00488 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
F13A1P00488 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
F13A1P00488 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
F13A1P00488 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
F13A1P00488 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
F13A1P00488 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
F13A1P00488 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
F13A1P00488 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
F13A1P00488 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
F13A1P00488 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
F13A1P00488 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
F13A1P00488 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
F13A1P00488 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
F13A1P00488 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
F13A1P00488 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
F13A1P00488 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
F13A1P00488 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
F13A1P00488 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
F13A1P00488 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
F13A1P00488 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
F13A1P00488 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
F13A1P00488 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
F13A1P00488 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
F13A1P00488 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
F13A1P00488 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
F13A1P00488 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
F13A1P00488 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
F13A1P00488 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
F13A1P00488 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
F13A1P00488 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
F13A1P00488 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
F13A1P00488 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
F13A1P00488 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
F13A1P00488 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
F13A1P00488 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
F13A1P00488 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
F13A1P00488 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
F13A1P00488 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
F13A1P00488 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
F13A1P00488 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
F13A1P00488 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
F13A1P00488 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
F13A1P00488 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
F13A1P00488 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
F13A1P00488 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
F13A1P00488 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
F13A1P00488 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
F13A1P00488 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
F13A1P00488 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
F13A1P00488 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
F13A1P00488 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
F13A1P00488 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
F13A1P00488 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
F13A1P00488 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
F13A1P00488 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
F13A1P00488 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
F13A1P00488 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
F13A1P00488 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
F13A1P00488 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
F13A1P00488 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
F13A1P00488 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
F13A1P00488 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
F13A1P00488 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
F13A1P00488 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
F13A1P00488 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms