Protein–RNA interactions for Protein: O95447

LCA5L, Lebercilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5LO95447 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LCA5LO95447 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCA5LO95447 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms