Protein–RNA interactions for Protein: O95196

CSPG5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG5O95196 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSPG5O95196 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSPG5O95196 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSPG5O95196 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSPG5O95196 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSPG5O95196 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CSPG5O95196 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSPG5O95196 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSPG5O95196 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSPG5O95196 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSPG5O95196 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSPG5O95196 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSPG5O95196 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSPG5O95196 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms