Protein–RNA interactions for Protein: O94850

DDN, Dendrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDNO94850 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDNO94850 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDNO94850 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
DDNO94850 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDNO94850 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDNO94850 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDNO94850 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDNO94850 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDNO94850 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDNO94850 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDNO94850 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDNO94850 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDNO94850 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDNO94850 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDNO94850 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDNO94850 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDNO94850 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
DDNO94850 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDNO94850 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDNO94850 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDNO94850 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDNO94850 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDNO94850 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDNO94850 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDNO94850 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDNO94850 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDNO94850 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDNO94850 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDNO94850 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDNO94850 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDNO94850 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDNO94850 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDNO94850 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDNO94850 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDNO94850 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDNO94850 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDNO94850 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDNO94850 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDNO94850 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDNO94850 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDNO94850 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDNO94850 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDNO94850 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDNO94850 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDNO94850 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
DDNO94850 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDNO94850 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDNO94850 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDNO94850 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDNO94850 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDNO94850 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDNO94850 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDNO94850 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
DDNO94850 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDNO94850 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
DDNO94850 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDNO94850 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDNO94850 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDNO94850 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
DDNO94850 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDNO94850 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDNO94850 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDNO94850 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDNO94850 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDNO94850 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDNO94850 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDNO94850 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
DDNO94850 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDNO94850 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDNO94850 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDNO94850 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDNO94850 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDNO94850 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDNO94850 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDNO94850 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDNO94850 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDNO94850 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDNO94850 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDNO94850 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDNO94850 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
DDNO94850 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDNO94850 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDNO94850 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDNO94850 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDNO94850 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDNO94850 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDNO94850 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDNO94850 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDNO94850 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DDNO94850 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDNO94850 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDNO94850 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDNO94850 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDNO94850 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDNO94850 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDNO94850 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDNO94850 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDNO94850 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDNO94850 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDNO94850 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms