Protein–RNA interactions for Protein: O94822

LTN1, E3 ubiquitin-protein ligase listerin, humanhuman

Predictions only

Length 1,766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTN1O94822 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LTN1O94822 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LTN1O94822 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LTN1O94822 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LTN1O94822 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LTN1O94822 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LTN1O94822 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LTN1O94822 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LTN1O94822 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LTN1O94822 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LTN1O94822 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LTN1O94822 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LTN1O94822 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LTN1O94822 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LTN1O94822 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LTN1O94822 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LTN1O94822 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LTN1O94822 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LTN1O94822 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LTN1O94822 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LTN1O94822 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LTN1O94822 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LTN1O94822 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
LTN1O94822 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LTN1O94822 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LTN1O94822 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LTN1O94822 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LTN1O94822 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LTN1O94822 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LTN1O94822 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LTN1O94822 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
LTN1O94822 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LTN1O94822 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LTN1O94822 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LTN1O94822 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LTN1O94822 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
LTN1O94822 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LTN1O94822 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LTN1O94822 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LTN1O94822 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
LTN1O94822 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LTN1O94822 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LTN1O94822 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LTN1O94822 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LTN1O94822 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LTN1O94822 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LTN1O94822 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LTN1O94822 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LTN1O94822 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LTN1O94822 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LTN1O94822 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
LTN1O94822 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
LTN1O94822 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LTN1O94822 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LTN1O94822 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LTN1O94822 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LTN1O94822 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
LTN1O94822 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LTN1O94822 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LTN1O94822 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LTN1O94822 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LTN1O94822 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LTN1O94822 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LTN1O94822 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LTN1O94822 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LTN1O94822 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LTN1O94822 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LTN1O94822 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LTN1O94822 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LTN1O94822 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LTN1O94822 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LTN1O94822 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LTN1O94822 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LTN1O94822 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LTN1O94822 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LTN1O94822 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LTN1O94822 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LTN1O94822 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LTN1O94822 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LTN1O94822 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
LTN1O94822 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LTN1O94822 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
LTN1O94822 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LTN1O94822 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LTN1O94822 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LTN1O94822 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LTN1O94822 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LTN1O94822 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LTN1O94822 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LTN1O94822 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LTN1O94822 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LTN1O94822 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
LTN1O94822 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LTN1O94822 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LTN1O94822 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LTN1O94822 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LTN1O94822 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LTN1O94822 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LTN1O94822 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LTN1O94822 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms