Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms