Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.982e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 FBXO34-204ENST00000555087 612 ntTSL 420.27■□□□□ 0.843e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 TBC1D5-221ENST00000452492 581 ntTSL 320.23■□□□□ 0.832e-8■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.622e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.592e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.528e-10■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.491e-8■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.484e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.458e-10■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.431e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 CLASP2-223ENST00000496954 685 ntTSL 417.64■□□□□ 0.418e-10■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.42e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.341e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.311e-8■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 CLASP2-217ENST00000486796 656 ntTSL 216.94■□□□□ 0.38e-10■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 SLC12A7-204ENST00000513223 1066 ntTSL 516.85■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.261e-8■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.258e-10■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.211e-8■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.21e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.148e-10■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 ABCD4-218ENST00000553486 1842 ntTSL 1 (best)15.82■□□□□ 0.121e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.091e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.071e-8■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.068e-10■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 TNIK-209ENST00000468757 1128 ntTSL 515.26■□□□□ 0.033e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.022e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 TBC1D5-206ENST00000423331 588 ntTSL 414.98□□□□□ -0.012e-8■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 ABCD4-219ENST00000553745 1770 ntTSL 214.84□□□□□ -0.031e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 ABCD4-210ENST00000481348 1177 ntTSL 514.79□□□□□ -0.041e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.058e-10■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 HINFP-203ENST00000527354 540 ntTSL 414.56□□□□□ -0.081e-19■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 TBC1D5-226ENST00000481396 609 ntTSL 414.49□□□□□ -0.092e-8■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 TBC1D5-216ENST00000444471 680 ntTSL 314.49□□□□□ -0.092e-8■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.112e-9■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 HINFP-209ENST00000529988 572 ntTSL 414.35□□□□□ -0.111e-19■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.136e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 MAEA-205ENST00000503653 845 ntTSL 314.07□□□□□ -0.162e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 ABCD4-207ENST00000474270 794 ntTSL 513.99□□□□□ -0.171e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 TBC1D5-207ENST00000425944 591 ntTSL 413.76□□□□□ -0.212e-8■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.214e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.258e-10■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 ABCD4-225ENST00000556517 947 ntTSL 313.46□□□□□ -0.251e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 HINFP-204ENST00000527410 1466 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.261e-19■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.261e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 TBC1D5-218ENST00000445294 623 ntTSL 213.35□□□□□ -0.272e-8■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.33e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 FBXO34-202ENST00000440021 2831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.33e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 ABCD4-211ENST00000481935 2336 ntTSL 512.98□□□□□ -0.331e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 TBC1D5-204ENST00000414349 687 ntTSL 312.89□□□□□ -0.352e-8■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 PRKCZ-207ENST00000466651 425 ntTSL 512.86□□□□□ -0.352e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 PSMF1-208ENST00000478004 632 ntTSL 212.69□□□□□ -0.382e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 HDAC6-230ENST00000488543 2484 ntTSL 212.62□□□□□ -0.391e-19■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 SLC12A4-203ENST00000537830 3525 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.483e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 ATP9B-203ENST00000458297 1507 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.51e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 SLC12A4-209ENST00000572037 3620 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.513e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 PSMF1-205ENST00000381899 704 ntTSL 211.7□□□□□ -0.542e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 SLC12A4-204ENST00000541864 3627 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.543e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 DYNLRB1-204ENST00000480759 1053 ntTSL 311.59□□□□□ -0.553e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 CLSTN3-201ENST00000266546 4185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.562e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 EVL-203ENST00000544450 3704 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.561e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 ABCD4-201ENST00000356924 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.571e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 TBC1D5-202ENST00000412981 592 ntTSL 311.5□□□□□ -0.572e-8■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 TBC1D5-215ENST00000443499 681 ntTSL 511.5□□□□□ -0.572e-8■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 SLC12A4-219ENST00000576616 3768 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.593e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 TBC1D5-208ENST00000428355 757 ntTSL 311.38□□□□□ -0.592e-8■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 ATP9B-201ENST00000307671 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.591e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 CLASP2-215ENST00000482896 580 ntTSL 411.33□□□□□ -0.68e-10■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 TBRG4-217ENST00000495973 3409 ntTSL 1 (best)11.31□□□□□ -0.61e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 CLSTN3-207ENST00000537408 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.622e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 MYBBP1A-207ENST00000573116 3795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)11.12□□□□□ -0.632e-9■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 MYBBP1A-202ENST00000381556 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.642e-9■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 TBC1D5-229ENST00000497531 672 ntTSL 310.88□□□□□ -0.672e-8■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 TBC1D5-211ENST00000430169 492 ntTSL 310.85□□□□□ -0.672e-8■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 SLC12A4-206ENST00000570802 3761 ntTSL 210.79□□□□□ -0.683e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 USP54-201ENST00000339859 6247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.693e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 TBC1D5-205ENST00000415814 852 ntTSL 310.33□□□□□ -0.762e-8■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 SHTN1-207ENST00000615301 6730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.828e-10■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 LARP7-201ENST00000324052 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.896e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 HINFP-206ENST00000529354 1051 ntTSL 29.42□□□□□ -0.91e-19■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 TBC1D5-220ENST00000446863 557 ntTSL 49.3□□□□□ -0.922e-8■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 ATP9B-202ENST00000426216 4361 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.941e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 COLGALT1-205ENST00000600474 552 ntTSL 48.96□□□□□ -0.983e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 FBXO34-206ENST00000557647 434 ntTSL 38.66□□□□□ -1.023e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 DYNLRB1-202ENST00000357156 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.023e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 LRRFIP2-210ENST00000440742 545 ntTSL 48.48□□□□□ -1.053e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 HINFP-201ENST00000350777 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.071e-19■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 HINFP-213ENST00000532312 3486 ntTSL 38.03□□□□□ -1.121e-19■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 HINFP-212ENST00000531360 748 ntTSL 47.74□□□□□ -1.171e-19■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 TBC1D5-214ENST00000443386 561 ntTSL 46.76□□□□□ -1.332e-8■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 TBC1D5-217ENST00000444756 545 ntTSL 46.76□□□□□ -1.332e-8■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.346e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 CAMKMT-206ENST00000428993 526 ntTSL 36.61□□□□□ -1.354e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 CLASP2-224ENST00000498331 452 ntTSL 46.58□□□□□ -1.368e-10■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 LARP7-211ENST00000509622 2020 ntTSL 1 (best)6.46□□□□□ -1.386e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 USP54-216ENST00000498143 4313 ntTSL 1 (best)5.27□□□□□ -1.573e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 DNAJC13-205ENST00000486798 2306 ntTSL 1 (best)5.21□□□□□ -1.581e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 CCNT2-209ENST00000464932 723 ntTSL 35.2□□□□□ -1.581e-19■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.768e-10■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 CWC27-205ENST00000545000 881 ntTSL 23.03□□□□□ -1.927e-8■■■■■ 160.8
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