Protein–RNA interactions for Protein: O75385

ULK1, Serine/threonine-protein kinase ULK1, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK1O75385 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ULK1O75385 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ULK1O75385 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ULK1O75385 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ULK1O75385 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ULK1O75385 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ULK1O75385 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ULK1O75385 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ULK1O75385 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ULK1O75385 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ULK1O75385 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ULK1O75385 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ULK1O75385 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ULK1O75385 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ULK1O75385 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ULK1O75385 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ULK1O75385 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ULK1O75385 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ULK1O75385 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ULK1O75385 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ULK1O75385 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ULK1O75385 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ULK1O75385 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ULK1O75385 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ULK1O75385 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ULK1O75385 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ULK1O75385 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ULK1O75385 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ULK1O75385 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ULK1O75385 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ULK1O75385 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ULK1O75385 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ULK1O75385 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ULK1O75385 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ULK1O75385 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ULK1O75385 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ULK1O75385 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ULK1O75385 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ULK1O75385 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ULK1O75385 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ULK1O75385 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ULK1O75385 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ULK1O75385 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ULK1O75385 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ULK1O75385 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ULK1O75385 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ULK1O75385 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ULK1O75385 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ULK1O75385 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ULK1O75385 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ULK1O75385 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ULK1O75385 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ULK1O75385 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ULK1O75385 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ULK1O75385 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ULK1O75385 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ULK1O75385 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ULK1O75385 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ULK1O75385 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ULK1O75385 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ULK1O75385 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ULK1O75385 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ULK1O75385 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ULK1O75385 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ULK1O75385 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ULK1O75385 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ULK1O75385 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ULK1O75385 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ULK1O75385 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ULK1O75385 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ULK1O75385 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ULK1O75385 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ULK1O75385 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ULK1O75385 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ULK1O75385 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ULK1O75385 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ULK1O75385 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ULK1O75385 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ULK1O75385 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ULK1O75385 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ULK1O75385 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ULK1O75385 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ULK1O75385 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ULK1O75385 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ULK1O75385 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ULK1O75385 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ULK1O75385 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ULK1O75385 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ULK1O75385 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ULK1O75385 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ULK1O75385 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ULK1O75385 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ULK1O75385 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ULK1O75385 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ULK1O75385 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ULK1O75385 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ULK1O75385 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ULK1O75385 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ULK1O75385 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ULK1O75385 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms