Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms