Protein–RNA interactions for Protein: O75298

RTN2, Reticulon-2, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN2O75298 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN2O75298 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN2O75298 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN2O75298 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN2O75298 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN2O75298 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN2O75298 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN2O75298 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN2O75298 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN2O75298 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN2O75298 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN2O75298 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN2O75298 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN2O75298 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN2O75298 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN2O75298 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN2O75298 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN2O75298 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN2O75298 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN2O75298 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN2O75298 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN2O75298 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN2O75298 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN2O75298 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN2O75298 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN2O75298 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN2O75298 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN2O75298 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN2O75298 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN2O75298 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN2O75298 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN2O75298 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN2O75298 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN2O75298 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN2O75298 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN2O75298 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN2O75298 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN2O75298 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN2O75298 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN2O75298 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN2O75298 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN2O75298 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN2O75298 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN2O75298 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN2O75298 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN2O75298 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN2O75298 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN2O75298 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN2O75298 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN2O75298 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN2O75298 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN2O75298 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN2O75298 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN2O75298 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN2O75298 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN2O75298 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN2O75298 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN2O75298 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN2O75298 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN2O75298 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN2O75298 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN2O75298 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN2O75298 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN2O75298 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN2O75298 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN2O75298 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN2O75298 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN2O75298 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN2O75298 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN2O75298 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN2O75298 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN2O75298 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN2O75298 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN2O75298 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN2O75298 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN2O75298 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN2O75298 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN2O75298 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN2O75298 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN2O75298 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN2O75298 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN2O75298 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN2O75298 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN2O75298 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN2O75298 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN2O75298 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN2O75298 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN2O75298 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN2O75298 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN2O75298 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN2O75298 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN2O75298 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN2O75298 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RTN2O75298 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RTN2O75298 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RTN2O75298 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RTN2O75298 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RTN2O75298 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RTN2O75298 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RTN2O75298 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms