Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEP104O60308 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEP104O60308 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEP104O60308 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEP104O60308 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEP104O60308 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEP104O60308 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEP104O60308 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEP104O60308 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEP104O60308 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP104O60308 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP104O60308 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP104O60308 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP104O60308 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP104O60308 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP104O60308 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP104O60308 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP104O60308 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP104O60308 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP104O60308 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP104O60308 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP104O60308 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP104O60308 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP104O60308 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP104O60308 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP104O60308 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP104O60308 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP104O60308 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP104O60308 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CEP104O60308 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CEP104O60308 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CEP104O60308 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CEP104O60308 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CEP104O60308 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CEP104O60308 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEP104O60308 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEP104O60308 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEP104O60308 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEP104O60308 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEP104O60308 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEP104O60308 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEP104O60308 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEP104O60308 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEP104O60308 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEP104O60308 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEP104O60308 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEP104O60308 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEP104O60308 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEP104O60308 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEP104O60308 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEP104O60308 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEP104O60308 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEP104O60308 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEP104O60308 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEP104O60308 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEP104O60308 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEP104O60308 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEP104O60308 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEP104O60308 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEP104O60308 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEP104O60308 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEP104O60308 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEP104O60308 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP104O60308 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP104O60308 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP104O60308 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP104O60308 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP104O60308 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP104O60308 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP104O60308 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP104O60308 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP104O60308 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP104O60308 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP104O60308 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP104O60308 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP104O60308 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP104O60308 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP104O60308 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP104O60308 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP104O60308 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP104O60308 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP104O60308 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP104O60308 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP104O60308 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP104O60308 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP104O60308 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP104O60308 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP104O60308 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP104O60308 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP104O60308 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP104O60308 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP104O60308 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP104O60308 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP104O60308 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP104O60308 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP104O60308 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP104O60308 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP104O60308 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP104O60308 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP104O60308 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms