Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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