Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CYTH3O43739 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CYTH3O43739 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYTH3O43739 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYTH3O43739 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYTH3O43739 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYTH3O43739 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYTH3O43739 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYTH3O43739 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CYTH3O43739 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYTH3O43739 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYTH3O43739 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYTH3O43739 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYTH3O43739 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYTH3O43739 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYTH3O43739 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYTH3O43739 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYTH3O43739 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYTH3O43739 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYTH3O43739 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CYTH3O43739 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYTH3O43739 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYTH3O43739 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYTH3O43739 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYTH3O43739 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYTH3O43739 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYTH3O43739 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYTH3O43739 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYTH3O43739 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYTH3O43739 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYTH3O43739 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYTH3O43739 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYTH3O43739 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYTH3O43739 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms