Protein–RNA interactions for Protein: O43280

TREH, Trehalase, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREHO43280 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TREHO43280 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TREHO43280 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TREHO43280 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TREHO43280 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TREHO43280 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TREHO43280 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TREHO43280 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TREHO43280 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TREHO43280 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TREHO43280 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TREHO43280 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TREHO43280 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TREHO43280 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TREHO43280 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TREHO43280 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TREHO43280 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TREHO43280 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TREHO43280 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TREHO43280 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TREHO43280 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TREHO43280 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TREHO43280 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TREHO43280 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TREHO43280 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TREHO43280 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TREHO43280 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TREHO43280 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TREHO43280 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TREHO43280 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TREHO43280 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TREHO43280 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TREHO43280 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TREHO43280 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TREHO43280 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TREHO43280 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TREHO43280 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TREHO43280 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TREHO43280 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TREHO43280 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TREHO43280 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TREHO43280 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TREHO43280 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TREHO43280 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TREHO43280 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TREHO43280 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TREHO43280 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TREHO43280 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TREHO43280 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TREHO43280 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TREHO43280 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TREHO43280 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TREHO43280 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TREHO43280 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TREHO43280 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TREHO43280 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TREHO43280 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TREHO43280 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TREHO43280 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TREHO43280 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TREHO43280 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TREHO43280 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TREHO43280 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TREHO43280 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TREHO43280 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TREHO43280 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TREHO43280 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TREHO43280 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TREHO43280 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TREHO43280 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TREHO43280 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TREHO43280 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TREHO43280 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TREHO43280 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TREHO43280 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TREHO43280 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TREHO43280 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TREHO43280 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TREHO43280 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TREHO43280 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TREHO43280 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TREHO43280 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TREHO43280 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TREHO43280 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TREHO43280 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TREHO43280 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TREHO43280 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TREHO43280 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TREHO43280 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TREHO43280 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TREHO43280 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TREHO43280 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TREHO43280 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TREHO43280 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TREHO43280 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TREHO43280 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TREHO43280 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TREHO43280 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TREHO43280 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TREHO43280 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms