Protein–RNA interactions for Protein: O15551

CLDN3, Claudin-3, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3O15551 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CLDN3O15551 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN3O15551 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN3O15551 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN3O15551 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN3O15551 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN3O15551 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN3O15551 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN3O15551 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN3O15551 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN3O15551 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms