Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOCS1O15524 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOCS1O15524 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOCS1O15524 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOCS1O15524 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOCS1O15524 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOCS1O15524 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOCS1O15524 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOCS1O15524 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOCS1O15524 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOCS1O15524 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOCS1O15524 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOCS1O15524 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOCS1O15524 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOCS1O15524 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOCS1O15524 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SOCS1O15524 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOCS1O15524 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SOCS1O15524 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOCS1O15524 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOCS1O15524 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOCS1O15524 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOCS1O15524 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SOCS1O15524 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms