Protein–RNA interactions for Protein: O15399

GRIN2D, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2D, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2DO15399 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIN2DO15399 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN2DO15399 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN2DO15399 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN2DO15399 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN2DO15399 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN2DO15399 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN2DO15399 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN2DO15399 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN2DO15399 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN2DO15399 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN2DO15399 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN2DO15399 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN2DO15399 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN2DO15399 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN2DO15399 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN2DO15399 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN2DO15399 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN2DO15399 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN2DO15399 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN2DO15399 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms