Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHOX2AO14813 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms