Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
APAF1O14727 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
APAF1O14727 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
APAF1O14727 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
APAF1O14727 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
APAF1O14727 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
APAF1O14727 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
APAF1O14727 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
APAF1O14727 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
APAF1O14727 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
APAF1O14727 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
APAF1O14727 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
APAF1O14727 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
APAF1O14727 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
APAF1O14727 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
APAF1O14727 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
APAF1O14727 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
APAF1O14727 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
APAF1O14727 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
APAF1O14727 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
APAF1O14727 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
APAF1O14727 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
APAF1O14727 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
APAF1O14727 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
APAF1O14727 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
APAF1O14727 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
APAF1O14727 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
APAF1O14727 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
APAF1O14727 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
APAF1O14727 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
APAF1O14727 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
APAF1O14727 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
APAF1O14727 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
APAF1O14727 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
APAF1O14727 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
APAF1O14727 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
APAF1O14727 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
APAF1O14727 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
APAF1O14727 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
APAF1O14727 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
APAF1O14727 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
APAF1O14727 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
APAF1O14727 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
APAF1O14727 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
APAF1O14727 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
APAF1O14727 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
APAF1O14727 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
APAF1O14727 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
APAF1O14727 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
APAF1O14727 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
APAF1O14727 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
APAF1O14727 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
APAF1O14727 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
APAF1O14727 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
APAF1O14727 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
APAF1O14727 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
APAF1O14727 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
APAF1O14727 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
APAF1O14727 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
APAF1O14727 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
APAF1O14727 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
APAF1O14727 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
APAF1O14727 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
APAF1O14727 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
APAF1O14727 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
APAF1O14727 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
APAF1O14727 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
APAF1O14727 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
APAF1O14727 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
APAF1O14727 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
APAF1O14727 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
APAF1O14727 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
APAF1O14727 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
APAF1O14727 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
APAF1O14727 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
APAF1O14727 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
APAF1O14727 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
APAF1O14727 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
APAF1O14727 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
APAF1O14727 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
APAF1O14727 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
APAF1O14727 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
APAF1O14727 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
APAF1O14727 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
APAF1O14727 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
APAF1O14727 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
APAF1O14727 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
APAF1O14727 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
APAF1O14727 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
APAF1O14727 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
APAF1O14727 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
APAF1O14727 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
APAF1O14727 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
APAF1O14727 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
APAF1O14727 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
APAF1O14727 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
APAF1O14727 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
APAF1O14727 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
APAF1O14727 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
APAF1O14727 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms