Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE40O14503 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE40O14503 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE40O14503 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms