Protein–RNA interactions for Protein: O00764

PDXK, Pyridoxal kinase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDXKO00764 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PDXKO00764 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDXKO00764 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDXKO00764 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDXKO00764 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDXKO00764 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PDXKO00764 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDXKO00764 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDXKO00764 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDXKO00764 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDXKO00764 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDXKO00764 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDXKO00764 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDXKO00764 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDXKO00764 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDXKO00764 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDXKO00764 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDXKO00764 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDXKO00764 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDXKO00764 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDXKO00764 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDXKO00764 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDXKO00764 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDXKO00764 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDXKO00764 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDXKO00764 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDXKO00764 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDXKO00764 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDXKO00764 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDXKO00764 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDXKO00764 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDXKO00764 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDXKO00764 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDXKO00764 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PDXKO00764 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDXKO00764 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDXKO00764 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PDXKO00764 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDXKO00764 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDXKO00764 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDXKO00764 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDXKO00764 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDXKO00764 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDXKO00764 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDXKO00764 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDXKO00764 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDXKO00764 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDXKO00764 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDXKO00764 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDXKO00764 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDXKO00764 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDXKO00764 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDXKO00764 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDXKO00764 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDXKO00764 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDXKO00764 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDXKO00764 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDXKO00764 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDXKO00764 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDXKO00764 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDXKO00764 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDXKO00764 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDXKO00764 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDXKO00764 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDXKO00764 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDXKO00764 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDXKO00764 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDXKO00764 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDXKO00764 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDXKO00764 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDXKO00764 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDXKO00764 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDXKO00764 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDXKO00764 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDXKO00764 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PDXKO00764 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PDXKO00764 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDXKO00764 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDXKO00764 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDXKO00764 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDXKO00764 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDXKO00764 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PDXKO00764 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDXKO00764 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDXKO00764 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDXKO00764 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDXKO00764 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDXKO00764 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDXKO00764 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDXKO00764 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDXKO00764 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDXKO00764 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDXKO00764 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDXKO00764 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDXKO00764 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDXKO00764 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDXKO00764 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDXKO00764 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDXKO00764 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDXKO00764 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms