Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
O00370 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
O00370 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
O00370 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
O00370 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
O00370 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
O00370 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
O00370 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
O00370 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
O00370 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
O00370 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
O00370 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
O00370 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
O00370 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
O00370 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
O00370 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
O00370 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
O00370 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
O00370 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
O00370 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
O00370 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
O00370 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
O00370 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
O00370 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
O00370 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
O00370 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
O00370 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
O00370 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
O00370 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
O00370 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
O00370 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
O00370 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
O00370 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
O00370 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
O00370 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
O00370 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
O00370 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
O00370 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
O00370 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
O00370 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
O00370 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
O00370 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
O00370 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
O00370 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
O00370 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
O00370 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
O00370 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
O00370 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
O00370 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
O00370 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
O00370 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
O00370 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
O00370 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
O00370 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
O00370 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
O00370 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
O00370 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
O00370 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
O00370 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
O00370 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
O00370 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
O00370 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
O00370 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
O00370 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
O00370 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
O00370 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
O00370 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
O00370 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
O00370 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
O00370 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
O00370 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
O00370 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
O00370 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
O00370 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
O00370 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
O00370 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
O00370 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
O00370 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
O00370 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
O00370 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
O00370 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
O00370 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
O00370 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
O00370 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
O00370 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
O00370 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
O00370 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
O00370 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
O00370 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
O00370 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
O00370 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
O00370 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
O00370 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
O00370 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
O00370 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
O00370 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
O00370 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
O00370 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
O00370 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
O00370 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms