Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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