Protein–RNA interactions for Protein: E9PAV3

NACA, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, muscle-specific form, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACAE9PAV3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NACAE9PAV3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms