Protein–RNA interactions for Protein: D6R9N7

USP17L18, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 18, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L18D6R9N7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L18D6R9N7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L18D6R9N7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L18D6R9N7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L18D6R9N7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L18D6R9N7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L18D6R9N7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L18D6R9N7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L18D6R9N7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L18D6R9N7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L18D6R9N7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L18D6R9N7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L18D6R9N7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L18D6R9N7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L18D6R9N7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L18D6R9N7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L18D6R9N7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L18D6R9N7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L18D6R9N7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L18D6R9N7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L18D6R9N7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L18D6R9N7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L18D6R9N7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L18D6R9N7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L18D6R9N7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L18D6R9N7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L18D6R9N7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L18D6R9N7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L18D6R9N7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L18D6R9N7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L18D6R9N7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L18D6R9N7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L18D6R9N7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L18D6R9N7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L18D6R9N7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L18D6R9N7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L18D6R9N7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L18D6R9N7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
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