Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms