Protein–RNA interactions for Protein: A8K830

COLCA2, Colorectal cancer-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLCA2A8K830 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COLCA2A8K830 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms