Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms